מהדורה זו של הש''ס יוצאת על פי תכניתו של הרב קוק זצ''ל בצרוף הלכה ברורה ובירור הלכה לפי המתכונת המפורטת להלן. הלכה ברורה – מודפסת בכל עמוד של הגמרא ובה תמצית דברי הפוסקים רמב''ם ושו''ע לפי הציונים של העין משפט. הדברים עצמם ערוכים מתוך כתב ידו של הרב זצ''ל ובהתאם להם נעשו כמה תיקונים לציונים של העין משפט. בעבודה זו מתקבלת תמונה מקיפה של ההלכות שנובעות מן הסוגיה ויש בה כדי לתת מימד חדש ללימוד הגמרא עצמה. בירור הלכה – בסוף הספר ימצא הלומד את הבירורים הערוכים במבנה מסודר ושיטתי, ובאים להציג את הנושא העיקרי שבכל סוגיה, כפי שלמדוהו בבתי המדרש במשך כל הדורות. חלק זה הוא פרי יצירתם של חברי המכון אשר בעמל רב טרחו לעיין בכל ספרי הראשונים והאחרונים שיש להם נגיעה לעניין הפסק היוצא מתוך הסוגיה ולהביא את השיטות השונות לפירוש הסוגיה בטעמיהן ובסיבות מחלוקתן, עד למסקנות הפוסקים הלכה למעשה. בסוף הספר צורפה רשימה של נושאי הברורים (כולל בירורים שהושמטו מהעין משפט) בכדי להקל על הלימוד למצוא את הנושא הרצוי. המטרה- לימוד בעיון עפ''י שיטתו של הרב קוק זצ''ל, המחבר בין ''עולם הגמרא'' לבין ''עולם הפסיקה ''. חיזוק הענין נימצא בדברי המאירי בהקדמה לספרו ''בית הבחירה'' וז''ל : ''כל מי שלא יחוש לידיעת פסק העניין לא יעלה בידו בהרבה מקומות אמיתת הפרוש... התועלת - בבירור הלכה ימצא הלומד היקף של הנושא הנידון בגמרא על כל השלכותיו כפי שדנו בו רבותינו הראשונים ואחרונים במבנה מסודר ועקבי, וכה אמר המהר''ל מפרג בספרו תפארת ישראל פרק נ''ו: ''לפי מעוט השכל שיש לנו ראוי שיהיה הלימוד שלהם מסודר בתכלית ובדבר זה היו מגיעים אל מדרגת מה '' המפעל - מלאכת מחשבת זו של סיכום קצר ובהיר של כל ההיקף העצום נעשית על ידי צוות של תלמידי חכמים בכירים שכבר קיבלו את הסכמותיהם של גדולי הדור וכבר רכשו ניסיון במשך 30 שנה ופרי עמלם כבר יצא לאור בשלוש עשרה מסכתות המוצעות כאן לפניכם.