תלמוד תורה מורשה נוסד בשנת תשל"ז על ידי קבוצת מחנכים בוגרי ישיבת מרכז הרב במטרה להעניק לתלמידי ירושלים מסגרת חינוכית תורנית ציונית ברוחו של מרן הרב קוק זצ"ל. מסגרת הלימודים בת"ת מורשה מתחילה בגילאי ק.ח. ובניהול התאגיד מצויים ארבעה גנ"י לגילאי ק.ח. וחובה הממוקמים במבנה ברח' קורות העיתים 4 וירושלים ובבניין הת"ת ברחוב אלקבץ 52 בגבעת שאול. בנוסף פועל הת"ת בכתות ביה"ס היסודי א-ח כתלמוד תורה ממלכתי דתי החל משנה"ל תשע"ב בו מתקיים יום לימודים ארוך משעה 7:15 בבוקר ועד לשעות הערב. כמו כן מפעילה העמותה ישיבה קטנה – מוסד תרבותי ייחודי כמוסד המשך לת"ת.
כחלק מן התכנית החינוכית של ת"ת מורשה מופעלת מזה שנים תכנית "ארץ נחלה" שמטרתה להגביר את הידע של התלמידים בהכרת העיר ירושלים ותולדותיה תוך קיום תכנית סיורים עניפה ומקיפה לכלל התלמידים. בנוסף נלמדת במסגרת זו גם ההיסטוריה של ההתיישבות הכללית בא"י ומאה שנות ציונות תוך שימת דגש על מרכזיותה של העיר ירושלים מאז ימי קדם. התכנית כוללת סיורים וטיולים בפריסה רחבה וחוגי של"ח הניתנים ע"י מדריכי הת"ת המונחים בעבודתם ע"י רכז התכנית המועסק במשרה מלאה בנושא זה.
התכנית להכרת ירושלים ותכנית "ארץ נחלה" מהוות דגם למוסדות חינוך נוספים בירושלים וברחבי הארץ כולה. העמותה פועלת לעריכת חומרי לימוד למערכת החמ"ד ומדריכה מורים ומנהלים ברחבי הארץ ליישום תכניות לימודים ייחודיות אלו.