מדרשת ירושלים שעל יד מכון שכטר ללימודי יהדות עוסקת בחיזוק הזהות היהודית והידע היהודי של עולים מארצות חבר העמים ומאתיופיה. פעילויות המדרשה בתחום זה החלו בשנת תש"ן כהענות לאתגר החינוכי שהציב גל העליה המיוחד מארצות אלה. גישתה החינוכית של מדרשת ירושלים משלבת לימוד מסורתי ואקדמי