'מדרשת ביחד' הינה בין היתר אכסניית נוער, המעבירה הדרכת סמינרים וטיולים לכ – 35,000 תלמידים מרחבי הארץ בשנה, כשהמסר המרכזי של הפעילות החינוכית הזו הוא ערכי ההתיישבות בנגב, שליחות ואחריות חברתית.
המדרשה, היא גם הבסיס הארגוני-חינוכי להבאת כ- 250 משפחות מבוססות ממרכז הארץ להתיישבות קבע בירוחם.