ייעודה של שקיפות בינ"ל ישראל, היא צמצום השחיתות בציבוריות הישראלית על-ידי הגברת המודעות לשקיפות ואתיקה בקרב הציבור בכלל, ומתן עזרה, עידוד ותמיכה לארגונים החפצים לקדם שקיפות ואתיקה בתוכם בפרט. "שקיפות בינ"ל ישראל" מפיצה בישראל את מדד השחיתות העולמי "CPI" ואת ברומטר השחיתות העולמי "GCB", הנערכים מידי שנה על-ידי ארגון "TI".